Protein A层析依赖于抗体与Protein A配体之间的特异性可逆结合。Protein A是一种天然存在于金黄色葡萄球菌细胞壁的56 kDa表面蛋白，由五个免疫球蛋白结合结构域组成，每个结构域均可通过Fc区重链结合多种哺乳动物的免疫球蛋白，其中对IgG的结合尤为显著。早期的第一代Protein A填料使用天然Protein A作为配体，而如今最普遍使用的是在大肠杆菌中表达的重组Protein A（rProtein A）。通过对配体蛋白结构的修饰、单结构域多聚体配体的出现以及多点固定等技术的应用，催生了现今所使用的耐碱、高载量且极其稳定的Protein A层析填料。
应用特点
Protein A填料是生物制药生产中最常用的亲和层析介质。Protein A层析因其特异性高、工艺稳健，常被用作捕获步骤。目前，它已是捕获重组单克隆抗体的标准技术。根据目标分子（如用于诊断检测的抗体）的预期用途，仅通过Protein A捕获这一步层析，有时即可达到所需的产品纯度。
